Genómica ambiental

¿Qué es la Genómica ambiental?

La genómica ambiental, también llamada metagenómica o genómica de comunidades, es una técnica de análisis que estudia el conjunto del ADN de los microorganismos presentes en un hábitat.

La genómica ambiental se realiza mediante tecnologías NGS (Next Generation Sequencing), y permite secuenciar el genoma de los distintos microorganismos, virus y bacterias presentes en un hábitat sin necesidad de aislarlos o hacer un cultivo in vitro.
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¿Para qué podemos usar la Genómica ambiental?

La ventaja de esta técnica es que nos permite obtener, con una sola muestra, información de la estructura de la comunidad microbiana, así como la función de los genes que la componen. Un ejemplo reciente de aplicación de esta técnica es que es posible detectar todas las variantes de SARS-CoV-2 presentes, por ejemplo, en aguas residuales, con un único análisis, inclusive, variantes aún no detectadas.

Por ello, la Genómica ambiental cubre una necesidad clara para distintos sectores: por un lado, ejercer esa vigilancia ambiental en momentos de alerta sanitaria, y por otro, la capacidad de caracterizar a toda la comunidad microbiana de una única vez.
Preguntas frecuentes
Resolvemos tus dudas sobre los servicios de genómica ambiental para la identificación de organismos, vigilancia de ecosistemas y análisis molecular avanzado en matrices ambientales.
¿Qué es la genómica ambiental y para qué sirve?
La genómica ambiental aplica técnicas moleculares avanzadas para detectar, identificar y cuantificar organismos presentes en el medio ambiente mediante el análisis de su material genético. Permite estudiar biodiversidad, vigilar ecosistemas y detectar especies o microorganismos difíciles de identificar por métodos tradicionales.
¿Qué es el ADN ambiental (eDNA)?
El ADN ambiental es el material genético que los organismos liberan al entorno a través de células, secreciones o restos biológicos. Su análisis permite identificar especies sin necesidad de capturarlas o observarlas directamente, facilitando estudios de biodiversidad y vigilancia ecológica.
¿Qué aplicaciones tiene la genómica ambiental?
La genómica ambiental se utiliza para:
  • Identificación de especies en ecosistemas acuáticos y terrestres
  • Detección de especies invasoras
  • Vigilancia de biodiversidad
  • Control de microorganismos en aguas y suelos
  • Estudios ecológicos y de impacto ambiental
¿Qué técnicas se utilizan en genómica ambiental?
Los análisis pueden incluir:
  • Secuenciación masiva (NGS)
  • Metabarcoding
  • Metagenómica
  • PCR cuantitativa (qPCR)
  • Extracción y purificación de ADN ambiental
¿Qué ventajas ofrece el uso de eDNA frente a métodos tradicionales?
El análisis de ADN ambiental permite:
  • Detectar especies difíciles de observar
  • Identificar organismos en bajas concentraciones
  • Reducir el impacto sobre los ecosistemas
  • Obtener resultados más rápidos y sensibles
  • Realizar estudios sin necesidad de capturas o muestreos invasivos
¿Qué matrices pueden analizarse mediante genómica ambiental?
LABAQUA analiza ADN ambiental en:
  • Aguas superficiales y subterráneas
  • Aguas residuales
  • Sedimentos y suelos
  • Biofilms
  • Matrices ambientales específicas según proyecto
¿Para qué sectores es útil la genómica ambiental?
Los servicios están dirigidos a:
  • Administraciones públicas
  • Consultoras ambientales
  • Proyectos de conservación y biodiversidad
  • Sector industrial y energético
  • Gestores de recursos hídricos
  • Centros de investigación y universidades
¿Qué beneficios aporta la genómica ambiental en la gestión del medio natural?
Aporta:
  • Mayor precisión en la identificación de especies
  • Detección temprana de riesgos ecológicos
  • Evaluación rigurosa del estado de los ecosistemas
  • Información clave para la toma de decisiones ambientales
  • Complemento avanzado a los métodos de muestreo tradicionales
¿Por qué elegir LABAQUA para estudios de genómica ambiental?
LABAQUA ofrece:
  • Laboratorio especializado en análisis molecular
  • Técnicas de secuenciación y qPCR de alta sensibilidad
  • Protocolos validados y trazables
  • Informes completos y orientados a la gestión ambiental
  • Experiencia en proyectos de biodiversidad y vigilancia ecológica

Proyecto GNOME: un paso más en el estudio de comunidades microbianas

Enmarcado dentro de las Ayudas Torres-Quevedo 2020, Labaqua desarrolla el Proyecto GNOME, cuyo objetivo es el desarrollo y puesta a punto de una nueva metodología basada en aproximaciones metagenéticas (secuenciación de genes diana) y metagenómicas (fragmentos genómicos totales) para su aplicación en el sector medioambiental.
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