Genómica ambiental

¿Qué es la Genómica ambiental?

La genómica ambiental, también llamada metagenómica o genómica de comunidades, es una técnica de análisis que estudia el conjunto del ADN de los microorganismos presentes en un hábitat.

La genómica ambiental se realiza mediante tecnologías NGS (Next Generation Sequencing), y permite secuenciar el genoma de los distintos microorganismos, virus y bacterias presentes en un hábitat sin necesidad de aislarlos o hacer un cultivo in vitro.
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¿Para qué podemos usar la Genómica ambiental?

La ventaja de esta técnica es que nos permite obtener, con una sola muestra, información de la estructura de la comunidad microbiana, así como la función de los genes que la componen. Un ejemplo reciente de aplicación de esta técnica es que es posible detectar todas las variantes de SARS-CoV-2 presentes, por ejemplo, en aguas residuales, con un único análisis, inclusive, variantes aún no detectadas.

Por ello, la Genómica ambiental cubre una necesidad clara para distintos sectores: por un lado, ejercer esa vigilancia ambiental en momentos de alerta sanitaria, y por otro, la capacidad de caracterizar a toda la comunidad microbiana de una única vez.
Preguntas frecuentes
Resolvemos tus dudas sobre genómica ambiental y cómo esta tecnología avanzada revoluciona el análisis de comunidades microbianas.
¿Qué es la genómica ambiental?
La genómica ambiental, también llamada metagenómica o genómica de comunidades, es una técnica de análisis que estudia el conjunto del ADN de los microorganismos presentes en un hábitat, permitiendo secuenciar el genoma de virus y bacterias sin necesidad de aislarlos o cultivarlos.
¿Cómo funciona la genómica ambiental?
La genómica ambiental se realiza mediante tecnologías NGS (Next Generation Sequencing), que permiten secuenciar comunidades microbianas completas en una muestra, obteniendo información sobre la estructura de la comunidad y la función de los genes que la componen.
¿Qué ventajas ofrece la genómica ambiental?
Con una sola muestra, la genómica ambiental permite:
  • Caracterizar toda la comunidad microbiana de una vez
  • Detectar microorganismos sin necesidad de cultivo
  • Identificar variantes de virus y bacterias
  • Analizar la función de genes presentes
  • Vigilancia ambiental en alertas sanitarias
  • Resultados más rápidos que métodos tradicionales
¿Para qué se utiliza la genómica ambiental?
La metagenómica tiene múltiples aplicaciones:
  • Vigilancia epidemiológica en aguas residuales
  • Detección de variantes de SARS-CoV-2 y otros patógenos
  • Control de calidad en procesos industriales
  • Monitorización ambiental de ecosistemas
  • Estudios de biodiversidad microbiana
  • Optimización de procesos de depuración
¿Qué es el Proyecto GNOME de LABAQUA?
El Proyecto GNOME, desarrollado con las Ayudas Torres-Quevedo 2020, es una iniciativa de I+D+i que desarrolla nuevas metodologías basadas en aproximaciones metagenéticas y metagenómicas para su aplicación en el sector medioambiental.
¿Qué puede detectar la genómica ambiental en aguas residuales?
En aguas residuales, la genómica ambiental puede detectar:
  • Todas las variantes de virus presentes (incluido SARS-CoV-2)
  • Bacterias patógenas y resistencias antimicrobianas
  • Comunidades microbianas completas
  • Variantes emergentes aún no detectadas
  • Indicadores de salud pública
¿A quién va dirigido el servicio de genómica ambiental?
Nuestro servicio está dirigido a:
  • Gestores de aguas residuales y EDARs
  • Administraciones públicas y organismos de salud
  • Centros de investigación
  • Industria alimentaria y farmacéutica
  • Empresas de tratamiento de agua
  • Consultoras ambientales
¿Qué diferencia la genómica ambiental de los análisis tradicionales?
La genómica ambiental ofrece:
  • Análisis completo de toda la comunidad microbiana
  • Sin necesidad de cultivo de microorganismos
  • Detección simultánea de múltiples patógenos
  • Identificación de variantes desconocidas
  • Mayor rapidez en resultados
  • Información funcional de los genes
¿Por qué elegir LABAQUA para genómica ambiental?
En LABAQUA ofrecemos:
  • Tecnología NGS de última generación
  • Proyecto GNOME de I+D+i propio
  • Equipo especializado en metagenómica
  • Experiencia en vigilancia epidemiológica
  • Análisis personalizados según necesidades
  • Interpretación experta de resultados

Proyecto GNOME: un paso más en el estudio de comunidades microbianas

Enmarcado dentro de las Ayudas Torres-Quevedo 2020, Labaqua desarrolla el Proyecto GNOME, cuyo objetivo es el desarrollo y puesta a punto de una nueva metodología basada en aproximaciones metagenéticas (secuenciación de genes diana) y metagenómicas (fragmentos genómicos totales) para su aplicación en el sector medioambiental.
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